Геймеры, играющие в «EteRNA», просто побеждают профессиональную науку в этом важном открытии

$config[ads_kvadrat] not found
Anonim

Гражданская наука просто перешла на следующий уровень: видеоигры сделали биологическое открытие, и теперь оно опубликовано в рецензируемом научном журнале.

Опубликовано на этой неделе в Журнал молекулярной биологии серия интуитивно разработанных правил о том, насколько трудной будет конкретная форма для достижения с помощью дизайна РНК. Например, они обнаружили, что чем более симметрична форма, тем сложнее будет разработать цепь РНК, соответствующую ей.

Коллектив видео-геймеров сделал открытие, играя, Eterna игра, в которой игрокам предлагается взять нити РНК и сложить их в желаемую форму, изменив их химический состав. Научная проблема объединения РНК в определенную форму сложна, но игры нет - для начала игры не требуется понимания биохимии.

Геймеры взялись за исследовательский вопрос по собственной инициативе, чтобы дать новым игрокам инструменты для оценки относительной сложности различных головоломок. Полученные результаты помогут направлять будущие биомедицинские исследования, поскольку новый свод правил дает ученым лучшее представление о том, является ли попытка свернуть РНК в заданную форму бесполезным занятием.

«Это исследование показывает, что стандартная парадигма научного краудсорсинга может быть изменена», - говорит Риху Дас, профессор биохимии в Стэнфорде. обратный в электронном письме Eterna была запущена в 2011 году Das и Adrien Treuille, доцентом кафедры компьютерных наук в Университете Карнеги-Меллона. « Eterna игроки могут придумывать свои собственные вопросы исследования и писать свои собственные статьи. В этом исследовании было небольшое руководство и независимое тестирование от экспертов в моей лаборатории ».

Синтезированная РНК обладает невероятным потенциалом для лекарств нового поколения и медицинской терапии. Если его можно сложить в правильную форму, можно построить РНК для борьбы с конкретными вирусами, раком и даже генетическими нарушениями. CRISPR, процесс редактирования генов, который может кардинально изменить будущее человеческого существования, использует РНК, чтобы направить фермент, разрезавший ДНК, Cas9, в нежелательный участок ДНК.

Eterna начал как форум для ученых-экспертов, чтобы представить головоломки для геймеров, но с тех пор он вырос за пределы этого. Игра и ее 100 000 зарегистрированных игроков в настоящее время находятся в симбиотических и развивающихся отношениях с профессиональными учеными и компьютерными моделями, созданными для проектирования и тестирования структуры РНК.

«Компьютерное моделирование и Eterna не являются эксклюзивными », - говорит Дас. « Eterna объединяет множество людей, некоторые из которых пишут свои собственные компьютерные модели ».

В текущей статье игроки совместно написали сценарии, чтобы проверить свои идеи относительно того, что делает структуры РНК трудными для проектирования. Дас говорит, что некоторые игроки сказали ему, что они особенно рады автоматизировать свои идеи в компьютерных моделях, потому что они хотят идти дальше и решать более сложные проблемы.

Проблемы построены Eterna игроки фактически продолжают синтезироваться в лаборатории Даса - до сих пор 86 459 сгенерированных игроками последовательностей были построены IRL.

Ведущие авторы статьи были Eterna геймеры Джефф Андерсон-Ли, Эли Фискер, Винеет Косараджу и Мишель Ву. Ву также доктор философии. студент в области биомедицинской информатики в Стэнфорде.

Возможно, в будущем гражданские эксперты начнут публиковать научные открытия совершенно независимо.

Этот шаблон «перевернутого краудсорсинга» для гражданской науки может быть полезен для других проектов и областей науки, таких как астрономия (Галактика Зоопарк) или краудсорсинг идентификации видов (Штрих-код жизни) », - говорит Дас. «Особенно, если они, как Eterna, видим узкие места на этапе написания бумаги ».

$config[ads_kvadrat] not found